1991년 11월에는 한국에너지기술연구소가 한국동력자원연구소에서 분리 독립하여 출범함으로써 새로운 도약과 발전을 향한 일대 전환을 이루었다. 이후 세계 에너지환경의 급속한 변화 속에 한국에너지기술연구소는 1990년대에 명실상부한 전문 에너지기술 연구기관으로서 부분적이고 단순한 에너지기술 개발의 차원을 넘어 급변하는 에너지 수급상황과 환경적 요구에 부응할 수 있는 종합적인 에너지시스템 기술의 개발 및 수요관리에 선도적인 역할을 수행해 나가기 시작했다.